Le conseil régional de Franche-Comté a décidé de financer, à hauteur de 20 %, 140 audits-diagnostics de dépollution dans les fromageries. L'agence de l'eau Rhône-Méditerranée-Corse est chargée de la gestion collective des aides accordées par la région.
Trente-sept entreprises ont déjà fait savoir qu'elles souhaitaient engager une étude, ce qui représente un coût global de 197 252 francs. Dans le cadre du contrat de Plan Etat-région (1994-1999), un soutien financier peut être ensuite octroyé pour subventionner les travaux internes de dépollution. La région bénéficie d'une dotation de 7,5 millions de francs, et l'Etat, d'une enveloppe de 12 millions.
